Район Богородское входит в число лучших по экологической обстановке районов ВАО Москвы.
По северной границе района проходит железная дорога Ярославского направления и платная магистраль «Московский скоростной диаметр», по южно-западной границе протекает река Яуза.
На местности отсутствуют крупные промышленные предприятия и дороги имеют малую загруженность. Это благоприятно влияет на экологию и сопутствует низкому негативному воздействию на окружающую среду.
На территории Богородского располагается несколько парковых зон, таких как Яузский лесопарк, благоустроенный парк «Янтарная горка», зеленая зона в «Синичкином сквере», а также небольшие скверы на улице Краснобогатырской и Миллионной.